Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCT3P49368 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCT3P49368 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCT3P49368 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCT3P49368 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCT3P49368 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCT3P49368 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCT3P49368 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCT3P49368 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCT3P49368 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCT3P49368 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCT3P49368 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCT3P49368 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCT3P49368 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCT3P49368 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCT3P49368 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCT3P49368 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCT3P49368 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCT3P49368 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCT3P49368 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCT3P49368 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCT3P49368 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCT3P49368 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCT3P49368 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCT3P49368 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCT3P49368 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCT3P49368 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCT3P49368 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCT3P49368 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCT3P49368 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCT3P49368 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCT3P49368 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCT3P49368 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCT3P49368 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCT3P49368 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCT3P49368 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCT3P49368 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCT3P49368 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCT3P49368 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCT3P49368 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCT3P49368 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCT3P49368 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCT3P49368 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms