Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5OP48047 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP5OP48047 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms