Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RANGAP1P46060 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms