Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 TXK-203ENST00000507351 1153 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC108471.2-205ENST00000529314 628 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC073651.1-201ENST00000544015 465 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 LINC01099-201ENST00000507011 512 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXD11P31277 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC005225.3-201ENST00000555972 519 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 CAPN3-219ENST00000569136 1029 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AC073529.1-202ENST00000608576 1080 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 U62317.5-201ENST00000609268 362 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD11P31277 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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