Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GCAP28676 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GCAP28676 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GCAP28676 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GCAP28676 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GCAP28676 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GCAP28676 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GCAP28676 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GCAP28676 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCAP28676 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms