Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXD10P28358 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD10P28358 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms