Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLD1P28340 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLD1P28340 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLD1P28340 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLD1P28340 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLD1P28340 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLD1P28340 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLD1P28340 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLD1P28340 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLD1P28340 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLD1P28340 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLD1P28340 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLD1P28340 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLD1P28340 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLD1P28340 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLD1P28340 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLD1P28340 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLD1P28340 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLD1P28340 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLD1P28340 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLD1P28340 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLD1P28340 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLD1P28340 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLD1P28340 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms