Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2AP28223 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms