Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms