Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF1P21675 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF1P21675 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF1P21675 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1P21675 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1P21675 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1P21675 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1P21675 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1P21675 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1P21675 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1P21675 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1P21675 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1P21675 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1P21675 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1P21675 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1P21675 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1P21675 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1P21675 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1P21675 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1P21675 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF1P21675 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1P21675 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1P21675 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1P21675 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1P21675 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1P21675 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1P21675 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1P21675 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1P21675 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1P21675 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1P21675 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1P21675 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1P21675 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1P21675 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1P21675 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1P21675 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms