Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB3BP20337 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms