Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CXCL2P19875 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CXCL2P19875 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms