Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB1P14653 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AC109466.1-206ENST00000522686 774 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 H3F3A-203ENST00000366815 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 GPALPP1-203ENST00000379151 1393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXB1P14653 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms