Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC192P0DO97 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms