Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPSNAP2O75323 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms