Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPLO60437 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPLO60437 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PPLO60437 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PPLO60437 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPLO60437 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPLO60437 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PPLO60437 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PPLO60437 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPLO60437 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPLO60437 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPLO60437 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPLO60437 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPLO60437 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPLO60437 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPLO60437 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPLO60437 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPLO60437 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPLO60437 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPLO60437 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPLO60437 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPLO60437 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPLO60437 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PPLO60437 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPLO60437 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPLO60437 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPLO60437 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPLO60437 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PPLO60437 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPLO60437 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PPLO60437 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPLO60437 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PPLO60437 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPLO60437 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPLO60437 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPLO60437 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPLO60437 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPLO60437 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PPLO60437 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PPLO60437 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPLO60437 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPLO60437 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPLO60437 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPLO60437 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPLO60437 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPLO60437 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PPLO60437 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPLO60437 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPLO60437 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPLO60437 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PPLO60437 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPLO60437 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPLO60437 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPLO60437 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPLO60437 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPLO60437 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPLO60437 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPLO60437 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPLO60437 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPLO60437 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPLO60437 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPLO60437 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPLO60437 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPLO60437 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPLO60437 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPLO60437 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPLO60437 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPLO60437 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPLO60437 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPLO60437 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPLO60437 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPLO60437 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPLO60437 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPLO60437 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPLO60437 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms