Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCO2O43819 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCO2O43819 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCO2O43819 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCO2O43819 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCO2O43819 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCO2O43819 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCO2O43819 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCO2O43819 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCO2O43819 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCO2O43819 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCO2O43819 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCO2O43819 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCO2O43819 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCO2O43819 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCO2O43819 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCO2O43819 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCO2O43819 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCO2O43819 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCO2O43819 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCO2O43819 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCO2O43819 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCO2O43819 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCO2O43819 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCO2O43819 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCO2O43819 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCO2O43819 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCO2O43819 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCO2O43819 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCO2O43819 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms