Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNF13O43567 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF13O43567 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF13O43567 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms