Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms