Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F3O00716 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F3O00716 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F3O00716 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F3O00716 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms