Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf172C9J069 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms