Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP3Q9Y446 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKP3Q9Y446 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKP3Q9Y446 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKP3Q9Y446 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKP3Q9Y446 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKP3Q9Y446 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKP3Q9Y446 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKP3Q9Y446 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKP3Q9Y446 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms