Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF8Q9UPP1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF8Q9UPP1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms