Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX7Q9UNH6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms