Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP25Q9UHP3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP25Q9UHP3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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