Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP68Q9UHB9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRP68Q9UHB9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms