Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms