Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR1EQ9GZS1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms