Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GSDMCQ9BYG8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms