Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BBS2Q9BXC9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms