Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFT27Q9BW83 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms