Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HIRIP3Q9BW71 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms