Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms