Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms