Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCMBPQ9BTE3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms