Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEMA3CQ99985 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms