Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX18Q96RF0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms