Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SORCS2Q96PQ0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms