Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SENP8Q96LD8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SENP8Q96LD8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms