Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms