Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ELP4Q96EB1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms