Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCTD12Q96CX2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms