Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD1Q8NHV4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms