Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TTC29Q8NA56 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms