Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C10orf53Q8N6V4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C10orf53Q8N6V4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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C10orf53Q8N6V4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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C10orf53Q8N6V4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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C10orf53Q8N6V4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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C10orf53Q8N6V4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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C10orf53Q8N6V4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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C10orf53Q8N6V4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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C10orf53Q8N6V4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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C10orf53Q8N6V4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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C10orf53Q8N6V4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C10orf53Q8N6V4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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