Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP98

C16orf47, Putative uncharacterized protein C16orf47, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf47Q6ZP98 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C16orf47Q6ZP98 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms