Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CBLN3Q6UW01 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBLN3Q6UW01 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms