Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZBED9Q6R2W3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms