Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3L3Q68CJ9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CREB3L3Q68CJ9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CREB3L3Q68CJ9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3L3Q68CJ9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3L3Q68CJ9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3L3Q68CJ9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3L3Q68CJ9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3L3Q68CJ9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3L3Q68CJ9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3L3Q68CJ9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3L3Q68CJ9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3L3Q68CJ9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3L3Q68CJ9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3L3Q68CJ9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3L3Q68CJ9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3L3Q68CJ9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3L3Q68CJ9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3L3Q68CJ9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3L3Q68CJ9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3L3Q68CJ9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CREB3L3Q68CJ9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms