Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TDRD12Q587J7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms